此次,刘青云不再是《扫毒1》里的正面警察,且一改往日的银幕好人形象,留长发蓄胡须,首次出演毒枭反派。古天乐诠释了与前两部中完全不同的角色,系列“新人”郭富城则挑战了更为复杂,有心理深度的人物类型。符生本是一心扑在医学上不谙世事的呆萌怪咖,却因为百医之死被误认为凶手,循着师父遗留的线索,他踏上了寻找“天书”的旅程;而文珏则是对万事充满好奇的鬼马少女,一向将别人玩弄于股掌之中的她却偏偏遇上了爱较真儿的符生,自此两人成为了欢喜冤家,就连整日放浪不羁的公子哥顾天都被符生“策反”走上了济世之路。迷案层层叠发,三人并肩同行,就这样开启了一段热血寻踪的冒险之旅。